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环球语翼-论文发表经验(3)

2016-06-20 16:17:17   来源:    点击:


第二讲 论文原著素材来源

在与国内科研人员交流过程中,他们常常问我:“你怎么会有那么多东西写?”今年 8 月初,我在武汉大学给研究 生和年轻医生做了场“一点之见即成文”的讲座。在这里我再稍稍整理一下,供“螺友”参考。 有趣的是,我自从涉足科研领域,就一直从事幽门螺旋杆菌(或幽门螺杆菌)的研究,因此,可以说我早就是位名 副其实的“螺友”。 下面言归正传,根据自身经历谈谈论文素材来源。

第一节 既定实验的完美结局:有心栽花花盛开 我读博士时的主要课题分两个方面,幽门螺杆菌耐药性和幽门螺杆菌感染“根除治疗”后复发。经过三年的努力, 在这两个方面均
有斩获。

前一课题所发的主要论文有:

1. Xia HX, Daw MA, Beattie S, Keane CT, O'Morain CA. Prevalence of

metronidazole-resistant Helicobacter pylori in dyspeptic patients. Ir J Med Sci. 1993 Mar;162(3):91-4. PMID: 8473130 [PubMed - indexed for MEDLINE]

2. Xia HX, Buckley M, Keane CT, O'Morain CA. Clarithromycin resistance in Helicobacter pylori: prevalence in untreated dyspeptic patients and stability in vitro. J Antimicrob Chemother. 1996 Mar;37(3):473-81. PMID: 9182104 [PubMed - indexed for MEDLINE]

后一课题所发的主要论文有:

1、Xia HX, Windle HJ, Marshall DG, Smyth CJ, Keane CT, O'Morain CA.

Recrudescence of Helicobacter pylori after apparently successful eradication: novel application of randomly amplified polymorphic DNA fingerprinting. Gut. 1995 Jul;37(1):30-4. PMID: 7672675 [PubMed - indexed for MEDLINE]

2、Xia HX, Gilvarry J, Beattie S, Hamilton H, Keane CT, Sweeney EC, O'Morain CA. Recrudescence of Helicobacter pylori

infection in patients with healed duodenal ulcer after treatment with different regimens. Am J Gastroenterol. 1995 Aug;90 (8):1221-5. PMID: http://www.wenkuxiazai.com/doc/56cb572c680203d8ce2f24d4-6.html 7639218 [PubMed - indexed for MEDLINE]

这些结果应该说是比较理想的,特别是后一课题,结果已足够博士毕业(直到现在,在国外也不一定要发 SCI 论文 才可毕业,但实验结果必须要达到 Internal and External Examiners 的要求)。所以,我 94 年博士毕业,论文的部分 结果在 1995-1999 年才发表。

值得一提的是我的第一篇 SCI 论文是 1993 年发在 Irish Journal of Medical Science 上的,这份杂志影响因子仅在 0.5

分以下。不过,这篇论文给我带来了英文论文写作经验,为以后论文写作打下坚实基础。

第二节 仔细观察试验意外现象:无心插柳柳成荫 幽门螺杆菌很“娇嫩”,只能在微需氧环境下生长。但我无意中发现有些菌株是可以经过“训练”从微需氧到需氧 过渡,并在需氧环境下生存和生长的。为此,我做了些验证试验,发了篇短文 Culture of

Helicobacter pylori under aerobic conditions on solid media. Xia HX, Keane CT, O'Morain CA. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 1994 May;13(5):406-9. PMID:

8070454 [PubMed - indexed for MEDLINE]。这一发现的意义在于从新的角度表明幽门螺杆菌 可能通过这种过渡能力在不利环境中生存并感染人群。 这只是我“意外观察、意外收获”的开端。在随后的研究中,我还“无意”发现幽门螺杆菌对克拉霉素的耐药性可 在无药传代过程中减弱甚至消失,表明幽门螺杆菌对克拉霉素的耐药性是不稳定的,从而解释为什么人群中幽门螺 杆菌对克拉霉素的耐药率相对幽门螺杆菌对灭滴灵的耐药率低的原因,更提示克拉霉素可以重复使用。这一结果发 在杂志 J Antimicrob Chemother 上 Xia HX,, Buckley M, Keane CT, O’Morain CA. Clarithromycin resistance in

Helicobacter pylori: prevalence in untreated dyspeptic patients and stability in vitro. J Antimicrob Chemother 1996; 37: 473-481.
真正有“革命性”的还是我到悉尼大学任高级研究人员(Senior Research Officer) 意外发现的结果。我将在第 7 节(计 划不如变化:山穷水尽疑无路,柳暗花明又一村)介绍。

所以,意外观察往往会有意外收获!

第三节 善用“公共”资源:它山之石,可以攻玉 许多医院或科室,尤其大型教学医院,长期积累了大量病案,特别是近 10 多年电脑使用日益普遍和规范,完整准 确收集病案资料已不再困难。事实上,美捷登已帮助很多临床医生发表了根据医院或科室积累的资料而撰写的论文。 这里,我想举三个论文案例。这三篇论文都是本人在香港玛丽医院工作时,经得有关领导和同事同意,利用科室或 同事的研究资料而撰写发表的。其中最后一篇是武汉大学夏教授和我利用他在香港大学作访问教授时短短的两个月 里完成的。

1. Xia HH, Wong BC, Wong KW, Wong SY, Wong WM, Lai KC, Hu WH, Chan CK, Lam SK. Clinical and endoscopic characteristics of non-Helicobacter pylori, non-NSAID duodenal ulcers: a long-term prospective study. Aliment Pharmacol Ther. 2001 Dec;15(12):1875-82.

2. Xia HH, Lai KC, Lam SK, Hu WH, Wong NY, Hui WM, Lau CP, Chen WH, Chan CK, Wong WM, Wong BC. Symptomatic response to lansoprazole predicts abnormal acid reflux in endoscopy-negative patients with non-cardiac chest pain. Aliment Pharmacol Ther. 2003 Feb;17(3):369-77. PMID: 12562449 [PubMed - indexed for MEDLINE]

3. Xia B, Xia HH, Ma CW, http://www.wenkuxiazai.com/doc/56cb572c680203d8ce2f24d4-7.html Wong KW, Fung FM, Hui CK, Chan CK, Chan AO, Lai KC, Yuen MF, Wong BC. Trends in the prevalence of peptic ulcer disease and Helicobacter pylori infection in family physician-referred uninvestigated dyspeptic patients in Hong Kong. Aliment Pharmacol Ther. 2005 Aug 1;22(3):243-

9. PMID: 16091062 [PubMed - indexed for MEDLINE]

第四节 毕业论文也是论文: 花开堪折直须折 对于现在大多数院校的研究生,尤其博士研究生而言,在毕业之前将研究结果发在 SCI 杂志上已是必需。因而,这 一话题似乎已不值得讨论。但许多年前的研究生,甚至于目前仍有少数院校的研究生(尤其硕士生)毕业并不需 SCI 论文。因此,我还是想谈谈这方面的经验。我本人在博士毕业时,已发表 7 篇原著 SCI 论文。其中大多是我博士课 题的结果,组成我博士论文的重要部分。这里暂不赘述。我想谈的是 2001 年我到武汉大学讲学时,我在国内合作 者的学生,一位很秀气的女孩拿着她的博士论文(中文)给我看,问我可不可以写成英文发表。我当时鼓励她先试 试。后来,她不仅发表了她的第一篇 SCI 论文(Yang Y, Deng CS, Peng JZ, Wong BC, Lam SK, Xia HH. Effect of Helicobacter pylori on apoptosis and apoptosis related genes in gastric cancer cells. Mol Pathol ( J Clin Pathol) 2003;56:19-

24.),还成为我在香港大学的第一个研究助理,目前是美国 John Hopkins 的高级研究人员。